2006年交流戦主要部門ベスト３
| 最優秀選手賞 | 小林 雅英 | ロッテ |
| 日本生命賞 | 佐藤 充 | 中日 |
| 松中 信彦 | 西武 |
| 打率 | 1 | 松中 信彦 | ソフトバンク | .408 |
| 2 | 福留 孝介 | 中日 | .390 | |
| 3 | カブレラ | 西武 | .377 | |
| 安打 | 1 | 青木 宣親 | ヤクルト | 53 |
| 1 | 福留 孝介 | 中日 | 53 | |
| 3 | カブレラ | 西武 | 52 | |
| 本塁打 | 1 | 李スンヨプ | 巨人 | 16 |
| 2 | リ グ ス | ヤクルト | 13 | |
| 3 | フェルナンデス | 楽天 | 12 | |
| 打点 | 1 | ラミレス | ヤクルト | 42 |
| 2 | フェルナンデス | 楽天 | 37 | |
| 3 | ウ ッ ズ | 中日 | 32 | |
| 盗塁 | 1 | 青木 宣親 | ヤクルト | 18 |
| 2 | 赤星 憲広 | 阪神 | 13 | |
| 3 | 福地 寿樹 | 西武 | 11 | |
| 3 | 西岡 剛 | ロッテ | 11 | |
| 防御率 | 1 | 佐藤 充 | 中日 | 0.91 |
| 2 | 川上 憲伸 | 中日 | 1.38 | |
| 3 | ガトームソン | ヤクルト | 1.66 | |
| 勝利 | 1 | 佐藤 充 | 中日 | 5 |
| 1 | 斉藤 和巳 | ソフトバンク | 5 | |
| 1 | 松坂 大輔 | 西武 | 5 | |
| 1 | ダグラス | 広島 | 5 | |
| セーブ | 1 | 小林 雅英 | ロッテ | 13 |
| 2 | マイケル中村 | 日本ハム | 9 | |
| 2 | 久保田智之 | 阪神 | 9 |
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